La finestra e' in fase di chiusura: non puoi modificarne l'href perche' al termine dell'esecuzione dell'istruzione non esisterebbe piu'.

Non so se possa essere efficace, ma se non vuoi aprire una popup (da chiudere alla risposta del server) puoi tentare con:

function notificaChiusuraPopUp(indice){
pippo = new Image();
pippo.src = "/Module/Servlet?indice="+indice+"&apri=false";
alert("hai chiuso il dettaglio");
}

ciao

ps: ricordati pero' che l'evento onunload scatta anche quando cambia la pagina contenuta e non solo alla chiusura... quindi anche ad ogni aggiornamento dalla opener.
vedi qui: http://pro.html.it/articoli/id_215/idcat_11/pro.html