le differenze sono sostanziali e ti consiglio di leggere qui http://itmanagement.earthweb.com/article.php/3683791

la GPLv3 è decisamente più restrittiva, ovviamente si tratta di una stretta motivata da accordi bislacchi ( legge Novell-Microsoft ) e da varie furbate commesse da talune società

un elemento chiave che tocca Linux è il fatto che la GPLv3 impedirebbe di inserire il codice per il supporto DRM nel kernel, quindi niente TCPA/Palladium, DRM e fregnacce simili