Vai nelle opzioni della cartella, clicchi sul tab "visualizzazione" e lì selezioni "visualizza file nascosti" e togli il segno di spunta da "nascondi i file protetti di sistema". Questi ultimi file comunque non vanno toccati, ma almeno vedi quanto spazio occupano. Hai eliminato tramite "pulitura disco" i punti di ripristino della configurazione di sistema?