premetto che no so usare il mysql comunque concettualmente potresti fare così ($array2 nel mio esempio corrisponde all'array che contiene la tabella 2 di cui parlavi tu)
codice:
<?PHP 
$array2 = tabella 2; 
$selezione = "SELECT * FROM tabella";
$risultato=mysql_query($selezione,$link);
while ($rec=mysql_fetch_row($risultato)) {

for($x=0;$x<sizeof($array2);$x++)
if($rec[1]==$array2[$x]){
?><span class="red"><?PHP echo "$rec[1] "; ?></span> <? break; 
}//chiudo if
if($x==(sizeof($array2)-1) )echo "$rec[1] "; 
}//chiudo for 

}//chiudo while
?>
capito il concetto puoi riadattare il ciclo alle tue esigenze