da qualche ulteriore ricerca e test mi pare confermata la mia seconda ipotesi:

posso usare più sezioni con i relativi marcatori a scalare,
quindi "ogni articolo" può avere tutti i titoli <h...>
quello che conta e che nell'ordine si abbia una succesione da 1 a 6
senza tornare indietro
(ma, nel caso, è possibile saltarne alcuni:
ad esempio passare da h1 ad h3 senza citare h2

un esempio:

codice:
<div id="primoarticolo">
<h1>titolo uno</h1>


testo dentro a primo articolo</p>
<h2>titolo due</h2>


parole riferite a titolo due</p>
</div>

<div id="secondoarticolo">
<h1>titolo uno secondo articolo</h1>


testo dentro a secondo articolo</p>
</div>
spero di avere conferme anche da parte vostra
( http://www.w3.org/2003/12/semantic-extractor.html
mi dice che va bene: interpreta correttamente )

spero che questa riflessione possa essere d'aiuto a qualcun'altro