Come prototype estende il DOM

[Mega69]

Ah scusa, per la fretta mi sono dimenticato che ovviamente la funzione deve anche ritornare l'oggetto:

function $(id) {
  var el = document.getElementById(id);
  for(var i in $.methods) {
    if(typeof($.methods[i]) == 'function')
      el[i] = $.methods[i];
  }
  return el;
}

In ogni caso questo è solo un esempio: se vuoi applicarlo andrebbero fatti vari miglioramenti ( ad esempio verificare se l'elemento ha già i metodi in modo da non doverli nuovamente applicare... )

Comunque ti ripeto, è molto meglio questo approccio:

function $(id) {
  return new $.klass(document.getElementById(id));
}

$.klass = function(el) {
  this.el = el;
}

$.klass.prototype = {
  'test': function() {
    alert(this.el.tagName);
  }
}