Dimenticavo: se vuoi aggiornare e per qualche motivo la shell non ti garba, esistono molti programmi che usano un frontend grafico (tipo adept, synaptic..) che ti permettono di marcare tutti i pacchetti per aggiornamenti.
Tieni presente che esiste anche aptitude, molto carino e simile a apt:

http://pollycoke.wordpress.com/2007/...-posto-di-apt/