Sì, lo puoi fare con JS.

codice:
<?
if ($a == "giallo")
   {
   echo "<script type='text/javascript'>".
          "window.open('http://www.ciao.it/pagina.php?var=".$a."');</script>".
          "<noscript>link per chi ha JS disabilitato.</noscript>";
   }
Problemi con questo approccio:
1) non funziona se l'utente non ha JS abilitato (ma puoi risolvere con il tag noscript come ho fatto sopra)
2) i popup blocker non amano window.open, quindi l'utente deve abilitare l'apertura di popup per il tuo sito.