Non ho guardato la versione di LuthoAerys, ma ho provato a modificare la versione 2.03.3 della lightbox in modo da renderla universale, sia che le thumbnails si trovino in un iframe o no.

si trova su http://www.fabriziocalderan.it/code/...3.3-iframe.zip

in pratica dovete editare il file js/lightbox.js e andare alla linea 77 in cui c'è una variabile

codice:
...
// True se le thumbnails sono in un iframe, false altrimenti
var isInIframe = true;
...
poi provate il file index.html compreso nello zip, settando la variabile isInIframe a true o false alternativamente per vederne il funzionamento.
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Update 15/02/2012: il link soprariportato non funziona più e, nel caso voleste chiedermelo, non ho più una copia dello zip. Le librerie si sono un po' evolute da quando ho scritto questo post e non userei più né mootols né lightbox. Quindi cercate qualcos'altro di più moderno e aprite una discussione se non sapete come modificare lo script