richiami una funzione onload ...
Purtroppo non posso utilizzare la funzione onload dato che il tutto è contenuto in file .php incluso in un altro dinamicamente e che ha già visualizzato il tag body.

...(o comunque quando sei certo tutti gli elementi siano stati definiti nel markup)
Che cosa vuoi dire? Che c'e' la possibilità di agire in modo diverso?