Come già consigliato in altri interventi, consiglio di effettuare l'analisi del log di HiJackThis su QUESTO SITO, non credo che serva a molto postare qui sul forum.

Riguardo al problema delle icone nella system tray puoi controllare se la loro visualizzazione è stata disattivata in questo modo:

Click destro sulla barra delle applicazioni -> Proprietà -> Scheda "Barra delle applicazioni" -> Personalizza (in basso a destra).