il problema e' su come richiami il frameCentrale, non sull'innerHTML

per IE name e ID di un oggetto sono in pratica la stessa cosa. Per FF no.

non uso mai i frames, per cui non sono un grande esperto ma prova al posto di

top.frames.FrameCentrale.location.href ="Professionisti.html";

a fare

document.getElementById("FrameCentrale").src ="Professionisti.html";