semplice, perchè fpdf non supporta l'utf8.
Dai un occhio a questa classe:
http://www.tecnick.com/public/code/c...aiocp_dp=tcpdf
E' praticamente fpdf ma con il supporto dell'utf8.
Non ho ancora avuto modo di provarla, ma credo che i metodi siano gli stessi, quindi non dovrai cambiare il tuo script.
ciao