Potresti fare ad esempio così:

Codice PHP:
<?php
$new_cod 
'1234567890'//10 cifre
$old_cod '1A234B567890'//12 cifre

$old_cod_trasf substr($old_cod,0,1).substr($old_cod,2,3).substr($old_cod,6,6);

if (
$old_cod_trasf==$new_cod) {echo 'I codici sono uguali';}
?>
Naturalmente per fare ciò è necessario che i caratteri in più siano sempre nella stessa posizione.