se ti fa selezionare più file non credo proprio che si tratti di ajax ... credo che si tratti di flash

http://www.devpro.it/javascript_id_99.html
http://www.devpro.it/FileReference/


Il file
http://www.devpro.it/FileReference/example.js

è il codice che devi usare per integrare il supporto per l'upload nella tua pagina, oltre ovviamente agli altri indicati prima, però questo è quello che effettivamente devi modificare.

Come vedi il codice, nell'evento onselect, utilizza solo l'elemento 0 ... li tu dovresti fare un ciclo sull'array e, volendo, lasciare il codice cosi più o meno com'è se non hai particolari esigenze