oppure al posto del popup (che puo' dar problemi in quanto ci sono i blocchi dei popup ecc) puoi usar 1 div tipo questo
Codice PHP:
st = document.createElement('style');
st.setAttribute('type','text/css');
st.innerHTML = '#nome { position:absolute; top:'+px+'px; left:'+py+'px;}';
document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(st);
div = document.createElement('div');
div.setAttribute('ID','nome');
div.style.color = "red";
div.innerHTML = "<font size='4'>Attendere prego</font>";
document.getElementsByTagName('body')[0].appendChild(div);
(e' il copiaincolla del div che uso io sempre quando voglio far qualcosa del genere:P)