Se gli antivirus non funzionano, si potrebbe provare o con le scansioni on line o vedere cosa esce fuori da systemscan..

Per le scansioni on line, puoi utilizzare Kaspersky_virusscanner o Bitdefender o Panda_activescan

Comunque, in ultimo scarica SystemScan, disconnetti il pc da internet => disattiva l'antivirus => esegui systemscan => spunta tutte le opzioni => clicca su "Scan Now". Finita la scansione, riattiva l'antivirus, carica il rapporto che trovi in C:\Suspectfile su Freefilehosting e posta il link ottenuto.

Rispondendo alla tua domanda, a questo punto ti converrebbe cominciare dal ripristino (sempre che sia possibile e che dia risultati).
Creare nuove partizioni.. non so.. :/ ....