No il problema non risiede li perchè con l'url scritto normale ovvero:
codice:
index.php?moduli=catalogo&sez=auto&tipo=Nuova&occ=2
il sito funziona bene.

Il problema ora è capire perchè riscrivendo l'url e facendo
Codice PHP:
print_r($_GET); 
l'unico array che mi restituisce è modulo => catalogo

manca invece
sez=>auto
tipo=>Nuova
occ=>2