se le tabelle hanno lo stesso nome campo devi specificare nella select il campo e tabella interessata( nometabella.campo ) quindi:
Codice PHP:
SELECT utenti.note, tutti gli altri campi ..FROM ......
//qui avrai nell'array $risultato_query['note'] 
se ti servono entrambi :
Codice PHP:
SELECT utenti.note as noteUtenti,  elenco.note as noteElenco, ..tutti gli altri campi .. FROM ......
//qui avrai nell'array $risultato_query['noteUtenti'] - $risultato_query['noteElenco']