hai cambiato la motherboard, praticamente hai cambiato macchina !
la ram: c'è solo quella nuova o ai fatto il mix?
la ventola sopra la CPU è fissata bene e gira?
hai pulito e rinnovato la cremina che migliora il contatto con il dissipatore?
l'alimentatore regge la nuova motherboard?
dalla descrizione il problema si manifesta a caldo, com'è l'aerazione all'interno del PC?

ciao