Con Eclipse di preciso non saprei...

cmq con RAD (che dovrebbe avere dei menu simili)
vai su Esegui -> Esegui... -> Applicazione Java
sotto ad Applicazione Java ci dovrebbe essere la tua classe main
la selezioni e vai sul secondo panellino (x)Argomenti e li trovi
Argomenti di programma
e
Argomenti VM

per eventuali soluzioni a livello di programmazione Java bisogna entrare nel codice e vedere se è possibile fare delle ottimizzazioni