solitamente si opera al contrario: prima si crea un sito statico, e poi quello con le animazioni.

comunque; se la struttura è già accessibile, puoi usare i files sorgente che hai creato (visto che li hai fatti tu, non è un problema recuperarli, giusto?.. basta che li ricavi dal fla)
ricomponi l'immagine, se eventualmente dovesse essere stata frammentata, usando un sw grafico
poi ti crei struttura e css