Si', in genere la document root e' quella

/var/www/html

guardaci dentro e vedi se c'e' la cartella phpmyadmin in qualche sottocartella

altre soluzioni:

1. come dicevi tu copiare direttamente di files del DB. Non ricordo in che cartella siano ma cercando li dovresti trovare (io ora sono su windows, magari stasera ti dico il percorso piu' probabile). Non sono pero' sicuro che cio' sia sufficientemente sicuro. Io l'ho fatto una volta e ha funzionato ma non mi pare sia molto ortodosso (ma Windows riesce a leggere gli HD linux? Da quando?)

2. installare una distribuzione Linux live sul tuo PC e con quella accedere all'altro HD e vedere cosa si riesce a fare