Sospendere un cliclo WHILE per un certo numero di secondi.

[cubalibre810]

se non puoi impostare il timeout dello script potresti pensare di dividere l'esecuzione in step richiamabili via GET (script.php?step=50, script.php?step=100, etc...)

in base ad $_GET['step'] Limiti la query ad X email

$ciclo = 50; // Mail da inviare ad ogni ciclo
$end = (int)$_GET['step'];
$start = $end - $ciclo;

mysql_query("...... LIMIT {$start}, {$end}"); 

Poi puoi gestire il redirect al prossimo step con JS

echo '
<script type="text/javascript">
<!--
function Redirect() 
{
   location.href = "script.php?step=' . ($end + $limit) . '";
}
window.setTimeout("Redirect()", 300000); //Fa partire il redirect dopo 5 minuti
//-->
</script>'; 

Certo, devi lasciare il browser aperto finche hai finito, però credo possa funzionare