prova a fare il boot con il cd di windows e
accedi alla console di ripristino con il tasto R,
poi digiti fdsik /mbr per ripristinare l'mbr
con la copia di backup sperando che funzioni.
Altrimenti prova nel forum di linux per sentire
come riparare questo tipo di problemi,
credo che da quelle parti sia piuttosto
comune questo tipo di inconvenienti e
magari hanno qualche consiglio mirato da darti.
luca