Premesso che non sò di cosa stai parlando la prova (il forum elimina le barre \) è quella di porre le \ davanti l'apice ['] per non farlo riconoscere come interruzione si stringa, altrimenti come non detto.
onClick="Run(\' excel.exe [url]http:////sr2k33//nuovo//Report//BILANCIO.xls\');" (fai un quote di questa risposta per vedere il codice corretto con le \)