Ho risolto, il principio di base è l'importazione di nodi, che con PHP 4 venivano clonati.
Con PHP 5 invece c'è il metodo importNode.

Posto il principio di base se dovesse servire a qualcuno:

Codice PHP:

<?php

$XML 
'<?xml version="1.0"?>
<books>
    <item>First book</item>
    <item>Second book</item>
    <code>23</code>
    <company>Michela</company>
</books>'
;

$doc1 = new DOMdocument;
$doc1->loadXML($XML);
$item $doc1->getElementsByTagName("item")->item(0);

$doc2 = new DOMdocument;
// true: import all nodes with childrens; false: only the specified node;
$importedElement $doc2->importNode($itemtrue);

$doc2->appendChild($importedElement);
$output $doc2->saveXML($doc2);
echo 
"[b]DOMDocument->importNode example[/b]
"
;


echo 
"Primo documento: 
"
.htmlentities($doc1->saveXML($doc1))."<hr />";
echo 
"Secondo documento con importazione di alcuni elementi del primo:
"
.htmlentities($doc2->saveXML($doc2))."<hr />";

?>
La stessa soluzione, inserita nella classe, risolve il mio problema.