Codice PHP:
$doc = new DOMDocument;
$doc->load('documento.xml');
$padre $doc->documentElement;
$primoFiglio $padre->getElementsByTagName('figlio')->item(0);
$nipoti $primoFiglio->getElementsByTagName('nipote');
foreach(
$nipoti as $nipote){
    if(
$nipote->getAttribute('path')=='pluto'){
        
$oldchapter $primoFiglio->removeChild($nipote);
    }
}
header('Content-Type: text/xml'); 
echo 
$doc->saveXML(); 
il modo + diretto.

XPath tanto per farti un'idea di cosa intendo con query.