Supponendo che il tuo stream di input si chiami is:
codice:
int intero1, intero2, intero3;
//...
//Imposta la base 16 come base di lettura dei numeri
is.setf(ios::hex,ios::basefield);
is>>intero1>>intero2>>intero3;
//Se dopo ti serve leggere numeri in base 10 ti basta fare così:
is.setf(ios::dec,ios::basefield);
.