Il mio problema è che sembra che non può essere letto.
Lo script di esempio (non è completo era solo per fare una prova) che ho provato è questo
$quanti = 5;
$indice = 256;
$contatore = 0;

$apri_xml = fopen("http://www.gigroup.it/w2net/webservice/elencofiliali.asmx/ElencoFiliali", 'r');

while(!feof($apri_xml))
{
$buffer = ltrim(Chop(fgets($apri_xml, $indice)));
$pos = strpos($buffer, "Table");
if (($pos === true) && ($contatore < $quanti))
{
$codice = ltrim(Chop(fgets($apri_xml, $indice)));
$codice = ereg_replace( "<C_FILIALE_COD>", "", $codice );
$codice = ereg_replace( "</C_FILIALE_COD>", "", $codice );

echo($codice . "
");

$contatore++;
}

}

fclose($apri_xml);