Io suggerirei:
1) Usare colori sulle tonalità pastello, rilassano maggiornmente la vista
2) La dimensione del font più indicata per il web è di 10/12px (possibilmente usare un unico tipo di font)
3) Mettere in evidenza (magari anche cromaticamente) i blocchi più importanti
4) Evitare di dare troppe info tutte in una pagina, la mente umana analizza a blocchi di dimensione 5+2 o 5-2, quindi anche nei menu restare intorno a questi valori per il numero di elementi, nel caso creare sottomenu.
5) Invece di usare una struttura tabellare prova con i div


Altre caratteristiche che dovrebbero avere dei siti web sono:
1) Brand Image (o logo, ben evidente e non facente parte di un blocco)
2) Una barra di navigazione che faccia ben capire il percorso che si è fatto per arrivare in un certo punto e renda facile tornare indietro
3) Evitare di inserire link con lo stesso nome, sembra assurdo ma spiazzano l'utente con cose del tipo: "o mamma...due link che si chiamano 'indice'...faranno la stessa cosa?!?"

Oltre a questi consigli generali non saprei come aiutarti :P