Credo che dipenda dal fatto che la finestra da normale deve essere trasformata in una layered window; questo potrebbe causare l'"annerimento" iniziale.
Per evitare il problema ti potrebbe bastare inserire nel New della classe form un
codice:
Me.Opacity = 0.9
Me.Opacity = 1
così da fare in modo che la finestra sia creata fin da subito come layered window.