Non so cosa intendi.
Il padding e` lo spazio interno al border (ha lo sfondo del blocco), ma la larghezza di un blocco si ottiene sommando:
margin + border + padding + width + padding + border + margin
Invece in IE quirks mode si ottiene:
margin + width + margin

Mi sa che dovresti ripassare la lezione sul box-nodel in qualsiasi tutorial CSS (ad esempio quello in HTML.it)