Prima di tutto dovrebbe essere un pò modificata la funzione ajaxLoader:
codice:
   function ajaxLoader(url,id,fn)
    {
        if (document.getElementById) {
            var x = (window.ActiveXObject) ? new ActiveXObject("Microsoft.XMLHTTP") : new XMLHttpRequest();
            }
            if (x)
                {
            x.onreadystatechange = function()
                    {
                if (x.readyState == 4 && x.status == 200)
                        {
                        if(id) {
                        var el = document.getElementById(id);
                        else el.innerHTML = x.responseText;
                        }
                        if(fn) fn(x);
                    }
                    }
                x.open("GET", url, true);
                x.send(null);
                }
                        
        }
Ora dovresti essere in grado di fare una cosa del genere:

Codice PHP:
function appendXML(id,xml,xsl) {
  ajaxLoader(xml, null, function(xml) {
    ajaxLoader(xsl, null, function(xsl) {
      if(xml.tranformNode)
        xml = xml.tranformNode(xsl);
      else {
        xml = (new XSLTProcessor());
        xml.importStylesheet(xsl);
        xml = xml.transformToFragment(xml, document);
      }
      document.getElementById(id).appendChild(xml);
    })
  })
}


<body onload="appendXML('contenuto', 'file.xml', 'file.xsl')"> 
Spero funzioni