Scusa ma forse non ho capito bene: su una data macchina hai 2 server di posta oppure hai un solo indirizzo pubblico che nasconde 2 server di posta? Nel qual caso prova con:

iptables -t nat -D PREROUTING -p tcp --dport 3389 -j DNAT --to-destination 10.0.0.1:3390

(riga da modificare)