Io quando l'ho scaricato l'ho avviato e ha fatto tutto da solo. Dopo quando mi serve su un progetto di NetBeans creo il progetto poi vado su File -> nomeProgetto properties e si apre una finestra. Nella finestra vado su Libraries clicco su Add Library qui compare un'altra finestra cerco il driver lo seleziono e faccio Add Library.

Fatto questo ho creato le funzioni che mi servono per scrivere e vedere il database MySQL.