Copia tutto in un sistema Unix like (Mac OS X, Linux, FreeBSD ecc..), modifica comodamente da shell, e riocopia il risultato in DOS...
;-)
Non c'è bisogno di questi passaggi e contropassaggi... Oltre alle utility già citate c'è la Powershell (disponibile per Windows XP e Vista) per le occasioni in cui si ha la necessità di usare una shell *seria*.