Non è proprio inspiegabile, magari appena accendi il PC ti carica una serie di servizi pesanti o ti fa la scansione all'avvio... I motivi possono essere tanti. Comunque se lo fa solo in alcuni momenti escluderei l'interferenza.
Per controllare a quanto lavora la CPU fai CTRL+ALT+CANC apri il task manager e vai alla voce "Prestazioni". Chiaramente fallo nel momento in cui il mouse va a scatti, perchè è li che bisogna vedere se la CPU è sovraccarica...