Ciao,
non c'è problema, puoi attaccare tranquillamente il connettore maschio a 20 pin dell'alimentatore al connettore femmina da 24 pin presente sulla scheda madre.
Gli altri 4 pin che rimangono vuoti sono quelli che servono per alimentare la CPU.
La CPU la dovrai alimentare utilizzando il piccolo connettore maschio da 4 pin dell'alimentatore collegandolo all'apposito connettore femmina presente sulla scheda madre (di solito si chiama 2X2 12V Power Connector).
Leggi a riguardo anche il manualetto della scheda madre. Comunque non ti puoi sbagliare perchè i connettori possono essere collegati in un solo verso (foolproof design).
Ciao!

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