Che DB usi?
Cmq così dovrebbe andare:
Codice PHP:
PreparedStatement pstmt = conn.prepareStatement ("INSERT INTO tabella (campoBLOB) VALUES (?)");
File fBlob = new File ( "tuoFile.ext" );
FileInputStream is = new FileInputStream ( fBlob );
pstmt.setBinaryStream (1, is, (int) fBlob.length() );
pstmt.execute ();
...