La tua domanda mi fa venire il sospetto che tu non sappia neppure cosa sia il robots.txt (scusa se non è così).
Prima ancora di porti il problema di dove porlo, dovresti decidere cosa inserirci.
Fatto questo, il robots.txt si pone nella root del sito con un normale programma di accesso FTP o con le utility di file management del tuo pannello. Non serve fare altro.
Semmai, tanto per essere sicuro di aver fatto tutto bene, prova a guardarlo col browser digitando www.sitotuo.xxx/robots.txt Se lo vedi, è tutto ok (contenuto a parte, ovviamente).