?? php.ini??
Allora tu vuoi usarlo via PHP, non usarlo come servizio di windows.

Guarda, in PHP MySQL e ODBC sono Built in, cioè fanno parte del core e non sono più un modulo a parte (dovrebbe essere così da parecchie versioni), quindi non devi fare alcuna modifica per farlo funzionare.

Per amministrare MySQL hai due opzioni:
La prima, la più semplice, vai su http://dev.mysql.com/downloads/gui-tools/5.0.html e scarichi MySQL administrator (questo però solo per MySQL 5.x), e con quello fai tutto.
La seconda è aprire il prompt di MS-DOS, fai
cd path\dove\ho\installato\mysql
cd bin
mysql.exe -u root

Dovrebbe andare