A me un'idea venuta.... e la sto mettendo in pratica se qualcuno ne ha una migliore bussi alla mia porta...!
ho creato uno script php che lancia dei comandi dalla shell di dos che esegue questi passaggi:
1) creo il dump di tutto il db
2) creo un db temporaneo
3) ricarico i dati del dump effettuato
4) eseguo delle query DELETE che mi permettono di togliere i dati che non mi interessano
5) rifaccio il dump del db filtrato
6) cancello il db temporaneo.
Ciao.