Io personalmente uso NetBeans, ma penso che anche per Eclipse sia lo stesso. Nel momento in cui compili il progetto, ti viene creata una cartella all'interno dello stesso contenente il file jar. (Mi pare si chiami dist, ma non ci metterei la mano sul fuoco...) Ti basta prendere quello! Devi solo conoscere il percorso della cartella del tuo progetto...(in NetBeans 6 è in Documenti -> NetBeansProjects).

Ciao!!