a mio parere per il tuo gestionale non è tanto un cms che ti serve, quanto delle classi robuste, affidabili e elastiche.

siccome devi lavorare con 2 db la classe che gestisce le query è fondamentale, nonchè quella per validare i dati e convertirli, ed infine quella per generare i report a colonne,a torta o quello che ti pare.

ti consiglio anche un buon sistema di configurazione, facilmente accessibile e gestibile