Non conosco il remote desktop web connection ma sul citrix ti posso dire che l'anno scorso una licenza per 5 client costava 1300-1400 euro.
I vantaggi che però hanno questi sistemi ti fanno poi risparmiare moltissimi soldi in manutenzione, assistenza e salute :-)

Secondo me il vero punto di forza è l'assistenza in quanto i client sono talmente semplici che hanno problemi solo se si rompono a livello hardware. Per tutti gli altri problemi il tecnico non deve spostarsi da dove sono locati i server.
Un altro vantaggio a lungo termine è il fatto prestazionale dei client in quanto dipendendo come prestazione dai server non c'è bisogno di cambiare i pc delle filiali ogni 3-4 anni come mediamente avviene per farli stare al passo. Un terminale lo usi finchè non si rompe, cioè anche dopo 10 anni e più.

Ogni client ha il suo desktop e fa solo quello che tu server gli permetti di fare senza interazione con altri client connessi.