Ho controllato tutto, il report di f-secure mi lascia perplesso, nessun file eliminato...poi controllo nel systemscan e il file knight.exe non è più presente, cosa peraltro rilevata anche da kaspersky, per le pen drive segui questa procedura:

tenendo premuto il tasto shift inserisci le pen drive, poi controlla le lettere che gli sono state assegnate, tipo H: - G: ecc

da start>esegui digita cmd , ti si aprirà un tabellino dos con c:\documents and settings\nome utente, digita cd\ ora vedrai sulla riga solo c:\, digita la lettera assegnata alla pendrive quindi h: e dai invio vedrai la riga con h:\ da qui digita:

del knight.exe poi dai invio
del autorun.inf poi dai invio

fai la stessa procedura per entrambe le penne e poi rifai una scansione on-line con kaspersky con le penne inserite, e posti il rapporto.