Ho risolto facendo così:
freccia su segnalibri, organizza segnalibri, si apre la finestra e digitiamo il pulsante "importa e salva" si apre una finestra a tendina e facciamo importa html, nel mio caso dovevo importare il file bookmarks.html e quindi ho selezionato "da un file html".
E così ho di nuovo in miei segnalibri su FF3.
Ciao