strano l'ho provato con Firefox e con IE 6 e 7 e funziona, forse non ti è chiaro il sistema:

tu inserirsci un numero qualsiasi, quando perde il focus lui, lo script, controlla se c'è la "," se si, quello che c'è dopo è tagliato a 2 cifre con arrotondamento corretto, mentre quello che c'è prima è, prima privato di eventuali ".", poi gli vengono inseriti i punti nei posti corretti (ogni tre cifre).

Tipo se tu inserisci il numero :

112453,225
poi clicchi fuori dall'input o premi tab il numero diventa:

112.453,22