funzione nella principale, richiamo dal documento in iframe
parent.nomeFunzione();

funzione nel documento in iframe, richiamo dalla principale
se l' iframe ha solo id:
document.getElementById('id_iframe').contentWindow .nomeFunzione();
se l' iframe ha solo name:
self.frames['nome_iframe'].nomeFunzione();

rispetta la tempistica (non pretendere di richiamare funzioni prima o durante il caricamento del documento in iframe) e funzionera'

ciao